人类饮用含高氯化物水，一般情况下对健康者无明显反应。特殊人群生理上不能适应，不少人会产生腹泻现象，尤其对患心脏病和肾脏病的人危害较大。从流行病学观点来看，采用高盐供水系统居民的循环系统发病率偏高，饮水中含高浓度氯化纳是不利因子之一。据华东师范大学河口所与上海自来水公司在上世纪90年代初的调查，基本不受盐水入侵影响的上海闵行区，死亡率占第一位的是癌症，循环系统疾病死亡率占第二位，而常受盐水入侵影响较严重的吴淞区，第一位死因是循环系统疾病，癌症占第二位。因此，强烈的咸潮入侵会使水源地氯化物含量长时间过高，危害人体健康和工农业生产，它是河口地区除洪、涝、台风之外的另一类自然灾害。