咸潮上溯是河口地区特有的自然现象，只要是河口区域，都会有咸潮上溯的现象发生。近年来珠江三角洲咸潮影响特别严重，主要原因在于：近十多年来，随着珠江三角洲地区经济高速发展、人口快速增长、城市化进程的加快，区域内用水量急剧上升，凸显了咸潮的影响。与历史相比，珠江三角洲总人口规模由1980年1259万人增加到将近5000万（含暂住人口和香港、澳门人口），城镇化率达70％，1980年到2000年城镇供水量增长了10倍以上，达到120亿m³/年。由于人口规模不断扩大、城市化率提高、经济快速发展，城镇与工业供水不断扩大，而当地水资源的调节能力相对不足；同时部分城市河段水污染严重，取水点分散，布局不合理，加剧了水资源供需矛盾；加上全球气候变暖导致海平面上升，流域中上游地区经济社会发展、用水量增加，珠江河口地区大量挖沙造成河床下切以及出海航道的疏浚等，所有这些因素，使得现在珠江三角洲咸潮入侵在流域历史年份同一降水量频率的情况下上溯有所加强，且咸潮发生频率越来越高，凸显了近年来珠江河口地区咸潮的影响。