我国水资源面临三大问题：一是洪涝灾害频繁，对经济发展和社会稳定的威胁大。90年代以来，我国几大江河发生了5次较大洪水。特别1998年长江、嫩江和松花江流域的特大洪水，充分说明洪涝灾害仍是我们的心腹之患。二是干旱缺水日趋严重。农业、工业以及城市都普遍存在缺水问题。北方河流干枯断流情况愈来愈严重。三是，水生态环境恶化。近年，我国水体水质总体上呈恶化趋势。全国约10万公里河长中，受污染的河长占46.5%。全国90%以上的城市水域受到不同程度的污染，水质性缺水问题严重。