水资源优化配置从宏观上讲，就是要对洪涝灾害、干旱缺水、水环境恶化等问题的解决实行统筹规划、综合治理。除害兴利结合，防洪抗旱并举，开源节流并重。妥善处理上下游、左右岸、干支流、城市与乡村、流域与区域、开发与保护、建设与管理、远期与近期等各方面的关系。从微观上讲，包括取用水及其综合体系的优化配置；地表水、地下水、大气水、土壤水，主水、客水，海水和污水回收再用；生态用水、环境用水、农业用水、工业用水、生活用水以及各种水源、水源点和各地各类用水户形成的庞大复杂的取用水体系，再考虑时间、空间的变化，实现水资源优化配置。